O bugio-preto (Alouattacaraya) é considerado “pouco preocupante” pela União Internacional para a Conservação da Natureza (UICN). No entanto, a espécie é considerada ameaçada em algumas listas estaduais, como no Rio Grande do Sul, São Paulo e Paraná.
As principais ameaças ao bugio-preto são: destruição do habitat, caça indiscriminada, tráfico e crescimento urbano. No Zoológico de Brasília, há nove bugios-pretos que fazem parte de projetos de conservação da espécie: Negão, Belle, Cusco, Mussashi, Bebezão, Filó, Frida e Bingo.
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